El nostre objectiu és avançar en el desenvolupament de tractaments més eficaços i personalitzats per a les malalties humanes de base microbiana, mitjançant una comprensió millor dels determinants biològics de salut i la malaltia a escala poblacional. Per aconseguir-ho, desenvolupem la nostra recerca al voltant de tres grans àrees d’interès:

1. Entendre el paper del microbioma intestinal en la salut humana i les malalties. Utilitzem la seqüenciació de nova generació per caracteritzar la distribució i la funció de la microbiota intestinal humana en diferents condicions de salut i malaltia. Actualment estem treballant en:

• Analitzar la influència del microbioma intestinal en la capacitat de les persones infectades pel VIH-1 per assolir una reconstitució immunitària adequada, controlar la replicació del VIH-1 i limitar la inflamació crònica associada a la infecció pel VIH-1.
• Caracteritzar la coevolució de la microbiota intestinal i el sistema immunitari després de la infecció aguda pel VIH-1.
• Entendre com el microbioma humà pot condicionar la resposta a la vacuna de la sida i a la inversa, és a dir, com les vacunes i altres estratègies d’eliminació del VIH-1 afecten el microbioma humà.

2. Millorar les eines de diagnòstic genotípic viral per maximitzar l’eficàcia del tractament antiretroviral. Hem estat pioners en la introducció de la seqüenciació de nova generació del VIH-1 a Europa i hem liderat alguns dels estudis seminals que han avaluat el valor clínic dels tests ultrasensibles de resistència i tropisme del VIH-1 en la resposta als tractaments antiretrovirals. Realitzem el nostre treball en estreta col·laboració amb companyies diagnòstiques i centres acadèmics d’Europa, els EUA i diversos països de l’Àfrica.

3. Definir l’epidemiologia clínica mundial del VIH-1. Treballem amb les principals cohorts clíniques europees ―EuroCOORD, ESAR i EuroSIDA― i grups de recerca africans i americans per entendre els efectes del virus en la resposta als tractaments, la progressió clínica a sida i la mort.